vfumedВестник Северо-Восточного федерального университета имени М.К. Аммосова. Vestnik of North-Eastern Federal University. Серия «Медицинские науки. Medical Sciences»Vestnik of North-Eastern Federal University. Medical Sciences2587-5590Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова10.25587/2587-5590-2025-3-63-76vfumed-373Research ArticleКЛИНИЧЕСКАЯ МЕДИЦИНАCLINICAL MEDICINEЭтиологическая структура и антибиотикорезистентность микроорганизмов у пациентов с хирургическим сепсисомEtiological structure and antibiotic resistance of microorganisms in patients with surgical sepsisШамаевД. А.ShamaevD. A.

Шамаев Дмитрий Александрович, ординатор 2-го года обучения по специальности анестезиология-реаниматология кафедры анестезиологии, реаниматологии и интенсивной терапии с курсом скорой медицинской помощи факультета последипломного обучения врачей медицинского института

г. Якутск 

Shamaev Dmitry Alexandrovich, 2nd-year resident, Institute of Medicine

Yakutsk, Oyunsky str., 27, 677000, Republic of Sakha (Yakutia)

clanshamaev@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2087-543XПотаповА. Ф.PotapovA. F.

Потапов Александр Филиппович, доктор медицинских наук, профессор, профессор кафедры анестезиологии, реаниматологии и интенсивной терапии с курсом скорой медицинской помощи факультета последипломного обучения врачей медицинского института

Web of Science ResearcherID AAG-6758-2019, Author ID (Scopus) 7201761921

г. Якутск 

Potapov Alexander Filippovich, Dr. Sci. (Medicine), Professor, Department of Anesthesiology, Resuscitation and Intensive Care with a course of emergency medicine of the Faculty of Postgraduate Training of Doctors, Institute of Medicine

Web of Science ResearcherID AAG-6758-2019, Author ID (Scopus) 7201761921

Yakutsk 

potapov-paf@mail.ruКоростелевА. С.KorostelevA. S.

Коростелев Александр Сергеевич, I заместитель генерального директора по лечебным вопросам

г. Якутск 

Korostelev Aleksandr Sergeevich, I Deputy Director General on Medical Issues

Yakutsk 

Korostelev1982@internet.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3782-6864ИвановаА. А.IvanovaA. A.

Иванова Альбина Аммосовна, доктор медицинских наук, доцент, заведующий кафедрой анестезиологии, реаниматологии и интенсивной терапии с курсом скорой медицинской помощи факультета последипломного обучения врачей медицинского института

Web of Science ResearcherID ААО-2223-2020, Author ID (Scopus) 55611584600

г. Якутск 

Ivanova Albina Ammosovna, Dr. Sci. (Medicine), Head, Department of Anesthesiology, Resuscitation and Intensive Care with a course of emergency medicine of the Faculty of Postgraduate Training of Doctors, Institute of Medicine

Web of Science ResearcherID ААО-2223-2020, Author ID (Scopus) 55611584600

Yakutsk 

iaa_60@mail.ruГригорьевГ. И.GrigorievG. I.

Григорьев Геннадий Иванович, врач анестезиолог-реаниматолог, заведующий отделением анестезиологии, реаниматологии и интенсивной терапии Клинического центра ГАУ Республики Саха (Якутии)

г. Якутск 

Grigoriev Gennady Ivanovich, аnesthesiologist, Head of the Department of Anesthesiology and Intensive Care Unit

Yakutsk 

grigin-64@rambler.ruСеверо-Восточный федеральный университет имени М.К. АммосоваРоссияM. K. Ammosov North-Eastern Federal UniversityRussian FederationСеверо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова ; Республиканская больница № 1 – Национальный центр медицины им. М.Е. НиколаеваРоссияM. K. Ammosov North-Eastern Federal UniversityRussian FederationРеспубликанская больница № 1 – Национальный центр медицины им. М.Е. НиколаеваРоссияRepublic Hospital № 1 – M. E. Nikolaev National Center of MedicineRussian Federation202530092025036376Copyright © Шамаев Д.А., Потапов А.Ф., Коростелев А.С., Иванова А.А., Григорьев Г.И., 20252025Шамаев Д.А., Потапов А.Ф., Коростелев А.С., Иванова А.А., Григорьев Г.И.Shamaev D.A., Potapov A.F., Korostelev A.S., Ivanova A.A., Grigoriev G.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.smnsvfu.ru/jour/article/view/373

Цель исследования – анализ этиологической структуры микроорганизмов и их резистентности к антимикробным препаратам у пациентов с хирургическим сепсисом. Проведено ретроспективное наблюдательное исследование в отделении анестезиологии, реанимации и интенсивной терапии (ОАРИТ) Клинического центра Государственного автономного учреждения Республики Саха (Якутия) «Республиканская больница № 1 – Национальный центр медицины им. М.Е. Николаева». Объект исследования – 30 хирургических больных, у которых течение послеоперационного периода осложнилось развитием сепсиса. Все пациенты лечились в ОАРИТ в 2022-2024 гг. Проведен анализ 370 микробиологических исследований биологических сред (перитонеальный экссудат, мокрота (аспират трахеи и бронхов), отделяемое ран, кровь, моча). Количество проб с ростом микроорганизмов составило 350 (94,6 %) образцов, без роста патогенов – 20 (5,4 %). Всего выделено 17 микроорганизмов, которые чаще выявлялись в виде смешанной инфекции. Среди микроорганизмов лидировали грамотрицательные микрорганизмы – Klebsiella pneumonia выделена в 26 (24,3 %), Acinetobacter baumannii в 18 (16,8 %) исследованиях. Другие клинически значимые возбудители – Enterococcus faecium, Escherichia coli и Pseudomonas aeruginosa обнаружены соответственно в 13 (12,1 %), 10 (9,3 %) и 4 (3,7 %) пробах. Грибковая инфекция обнаружена в 21 (19,6 %) исследовании и представлена в основном Candida glabrata (11,2 %) и Candida albicans (6,5 %). Анализ устойчивости к антибиотикам показал, что против Klebsiella pneumonia активны аминогликозиды (Амикацин) и цефалоспорины III поколения (Цефотаксим и Цефтазидим). Активность к Acinetobacter baumannii проявляют Амикацин, карбапенемы (Имипенем, Меропенем) и умеренную активность фторхинолоны (Ципрофлоксацин). Высокая эффективность при Enterococcus faecium отмечается у Ванкомицина и Линезолоида. У пациентов с хирургическим сепсисом микробная флора представлена представителями внутрибольничных штаммов с высокой устойчивостью к антибактериальным препаратам, включая препараты резерва. Микробиологический мониторинг, выявление и контроль локальной антибиотикорезистентности позволяет оптимизировать и повысить эффективность противомикробной терапии.

The aim of the study was to analyze the etiological structure of microorganisms and their resistance to antimicrobial drugs in patients with surgical sepsis. Research materials and methods. A retrospective observational study was conducted in the Department of Anesthesiology and Intensive Care Unit at the Republic Hospital № 1 – M. E. Nikolaev National Center of Medicine. The object of the study is 30 surgical patients with sepsis. All patients were treated in the period 2022–2024. The analysis of 370 microbiological studies of biological media (peritoneal exudate, sputum (tracheal and bronchial aspirate), wound discharge, blood, urine) was carried out. The results of the study. The number of samples with the growth of microorganisms was 350 (94.6 %) samples, without the growth of pathogens –- 20 (5.4 %). A total of 17 microorganisms were isolated, which were more often observed as a mixed infection. Gram-negative microorganisms were the leaders among microorganisms. Klebsiella pneumonia was isolated in 26 (24.3 %); Acinetobacter baumannii – in 18 (16.8 %) studies. Other clinically significant pathogens, Enterococcus faecium, Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa, were found in 13 (12.1 %), 10 (9.3 %) and 4 (3.7 %) samples. Fungal infection was detected in 21 (19.6 %) studies and is mainly represented by Candida glabrata (11.2 %) and Candida albicans (6.5 %). The analysis of antibiotic resistance showed that aminoglycosides (Amikacin) and thirdgeneration cephalosporins (Cefotaxime and Ceftazidime) are active against Klebsiella pneumonia. Activity against Acinetobacter baumannii is shown by Amikacin, carbapenems (Imipenem, Meropenem) and moderate activity of fluoroquinolones (Ciprofloxacin). High efficacy in Enterococcus faecium is noted in Vancomycin and Linezoloid. Conclusion. In patients with surgical sepsis, the microbial flora is represented by representatives of nosocomial agents with high resistance to antibacterial drugs, including reserve drugs. Microbiological monitoring, detection and control of local antibiotic resistance makes it possible to optimize and increase the effectiveness of antimicrobial therapy.

хирургический сепсисмикрофлоравнутрибольничная инфекцияKlebsiella pneumoniaAcinetobacter baumanniiEnterococcus faeciumантибактериальная терапияантибактериальная резистентностьsurgical sepsismicrofloranosocomial infectionKlebsiella pneumoniaAcinetobacter baumanniiEnterococcus faeciumantibacterial therapyantibacterial resistanceИсследования выполнено в рамках научно-исследовательской работы профессиональной образовательной программы высшего образования (ординатура) по специальности 31.08.02. Анестезиология-реаниматология без дополнительного финансирования.The research was carried out as part of the research work of the professional educational program of higher education (residency) in the specialty 08.31.02. Anesthesiology-Reanimatology without additional funding.ReferencesАлиев С.А., Алиев Э.С. Абдоминальный сепсис: состояние проблемы, интегральные системы оценки тяжести течения и критерии прогнозирования исхода. Вестник хирургии имени И.И. Грекова. 2018;177(5):108–112. https://doi.org/10.24884/0042-4625-2018-177-5-108-112.Aliev S.A., Aliev E.S. Abdominal sepsis: the state of the problem, integral system for assessing the severity of sepsis and criteria for predicting the result. Grekov’s Bulletin of Surgery. 2018;177(5):108–112 (in Russian). https://doi.org/10.24884/0042-4625-2018-177-5-108-112.Huston J.M., Barie P.S., Dellinger E.P., et al. Therapeutics and Guidelines Committee. The Surgical Infection Society Guidelines on the Management of Intra-Abdominal Infection: 2024 Update. Surg Infect (Larchmt). 2024;25(6):419–435. https://doi.org/10.1089/sur.2024.137.Huston J.M., Barie P.S., Dellinger E.P., et al. Therapeutics and Guidelines Committee. The Surgical Infection Society Guidelines on the Management of Intra-Abdominal Infection: 2024 Update. Surg Infect (Larchmt). 2024;25(6):419–435. https://doi.org/10.1089/sur.2024.137.Clements T.W, Tolonen M., Ball CG, Kirkpatrick AW. Secondary Peritonitis and Intra-Abdominal Sepsis: An Increasingly Global Disease in Search of Better Systemic Therapies. Scand J Surg. 2021;110(2):139–149. https://doi.org/10.1177/1457496920984078.Clements T.W, Tolonen M., Ball CG, Kirkpatrick AW. Secondary Peritonitis and Intra-Abdominal Sepsis: An Increasingly Global Disease in Search of Better Systemic Therapies. Scand J Surg. 2021;110(2):139–149. https://doi.org/10.1177/1457496920984078.Kirkpatrick, A.W., Coccolini, F., Tolonen, M. et al. The unrestricted global effort to complete the COOL trial. World J Emerg Surg. 2023;18(33). https://doi.org/10.1186/s13017-023-00500-z.Kirkpatrick, A.W., Coccolini, F., Tolonen, M. et al. The unrestricted global effort to complete the COOL trial. World J Emerg Surg. 2023;18(33). https://doi.org/10.1186/s13017-023-00500-z.Vincent J.L., Sakr Y., Singer M. et al. EPIC III Investigators. Prevalence and Outcomes of Infection Among Patients in Intensive Care Units in 2017. JAMA. 2020; 323(15): 1478-1487. https://doi.org/10.1001/jama.2020.2717.Vincent J.L., Sakr Y., Singer M. et al. EPIC III Investigators. Prevalence and Outcomes of Infection Among Patients in Intensive Care Units in 2017. JAMA. 2020; 323(15): 1478-1487. https://doi.org/10.1001/jama.2020.2717.Руднов В.А., Бельский Д.В., Дехнич А.В., исследовательская группа РИОРИТ. Инфекции в ОРИТ России: результаты многоцентрового исследования. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.2011;13(4):294–303.Rudnov V.A., Belsky D.V., Dehnich A.V. RIORIT Research Group. Infections in the Russian ICU: results of a multicenter study. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2011;13(4):294–303 (in Russian).Кулабухов В.В. Инфекционный контроль и антибактериальная терапия: результаты исследования РИОРИТа-2. https://rutube.ru/video/77f7d88f5272b21a37f85b632a88d527/.Kulabukhov V.V. Infection control and antibacterial therapy: results of the RITa-2 study (in Russian). Available at: https://rutube.ru/video/77f7d88f5272b21a37f85b632a88d527Nofal M.A., Shitawi J., Altarawneh H.B et al. Recent trends in septic shock management: a narrative review of current evidence and recommendations. Ann Med Surg (Lond). 2024;86(8):4532–4540. https://doi.org/10.1097/MS9.0000000000002048.Nofal M.A., Shitawi J., Altarawneh H.B., et al. Recent trends in septic shock management: a narrative review of current evidence and recommendations. Ann Med Surg (Lond). 2024;86(8):4532–4540. https://doi.org/10.1097/MS9.0000000000002048.Клинические рекомендации Министерства здравоохранения Российской Федерации «Сепсис (у взрослых)», 2024. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/898_1.Clinical recommendations of the Ministry of Health of the Russian Federation “Sepsis (in adults)”, 2024 (in Russian). Available at: https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/898_1.Rello J., Sawyer R.G., Sganga G. et al. Intra-abdominal infections survival guide: a position statement by the Global Alliance For Infections In Surgery. World J Emerg Surg. 2024;19(1): 22. https://doi.org/10.1186/s13017-024-00552-9.Rello J., Sawyer R.G., Sganga G. et al. Intra-abdominal infections survival guide: a position statement by the Global Alliance For Infections In Surgery. World J Emerg Surg. 2024;19(1):22. https://doi.org/10.1186/s13017-024-00552-9.Rüddel, H., Thomas-Rüddel D.O., Reinhart K. et al. Adverse effects of delayed antimicrobial treatment and surgical source control in adults with sepsis: results of a planned secondary analysis of a cluster-randomized controlled trial. Crit Care. 2022;26(51):14. https://doi.org/10.1186/s13054-022-03901-9.Rüddel, H., Thomas-Rüddel D.O., Reinhart K. et al. Adverse effects of delayed antimicrobial treatment and surgical source control in adults with sepsis: results of a planned secondary analysis of a cluster-randomized controlled trial. Crit Care. 2022;26(51):14. https://doi.org/10.1186/s13054-022-03901-9.Blot S., Antonelli M., Arvaniti K., et al. Epidemiology of intra-abdominal infection and sepsis in critically ill patients: “AbSeS”, a multinational observational cohort study and ESICM Trials Group Project. Intensive Care Med. 2019;45(12):1703–1717. https.//doi.org/10.1007/s00134-019-05819-3.Blot S., Antonelli M., Arvaniti K., et al. Epidemiology of intra-abdominal infection and sepsis in critically ill patients: “AbSeS”, a multinational observational cohort study and ESICM Trials Group Project. Intensive Care Med. 2019;45(12):1703–1717. https://doi.org/10.1007/s00134-019-05819-3.Российские рекомендации. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Версия 2024-02. Год утверждения (частота пересмотра): 2024; МАКМАХ, СГМУ: Смоленск:192. https://www.antibiotic.ru/minzdrav/category/clinical-recommendations/.Russian recommendations. Determination of the sensitivity of microorganisms to antimicrobial drugs. Version 2024-02. Year of approval (frequency of revision): 2024; MAKMAKH, SSMU: Smolensk: 192 (in Russian). https://www.antibiotic.ru/minzdrav/category/clinical-recommendations.Программа СКАТ (Стратегия Контроля Антимикробной Терапии) при оказании стационарной медицинской помощи: Российские клинические рекомендации. Под ред. С. В. Яковлева, Н. И. Брико, С. В. Сидоренко, Д. Н. Проценко. М.: Издательство «Перо». 2018;156.The SCAT Program (Antimicrobial Therapy Control Strategy) in the provision of inpatient medical care: Russian clinical guidelines. Edited by S. V. Yakovlev, N. I. Briko, S. V. Sidorenko, D. N. Protsenko. Moscow: Pero Publishing House. 2018;156 (in Russian).Zaragoza R., Vidal-Cortés P., Aguilar G. Update of the treatment of nosocomial pneumonia in the ICU. Crit Care. 2020;24(1):383. https://doi.org/10.1186/s13054-020-03091-2.Zaragoza R., Vidal-Cortés P., Aguilar G. Update of the treatment of nosocomial pneumonia in the ICU. Crit Care. 2020;24(1):383. https://doi.org10.1186/s13054-020-03091-2.Кузьмина А.А., Климова Т.М., Шамаева С.Х. и др. Мониторинг распространенности и антибиотикорезистентности штаммов Kkebsiella pneumonia в многопрофильном стационаре. Якутский медицинский журнал. 2024;4(88):60–63. https://doi.org/10.25789/YMJ.2024.88.14.Kuzmina A.A., Klimova T.M., Shamaeva S.Kh., et al. Monitoring of the prevalence and antibiotic resistance of Klebsiella pneumoniae strains in a multidisciplinary hospital. Yakut Medical Journal. 2024;4(88):60–63 (in Russian). https://doi.org/10.25789/YMJ.2024.88.14.Шамаева С.Х., Маркова В.Н., Егорова А.В. и др. Мониторинг карбапенемрезистентных Escherichia coli и Klebsiella pneumonia в условиях многопрофильного стационара. Тезисы XXV международного конгресса МАКМАХ по антимикробной терапии и клинической микробиологии. г. Москва, 24–26 мая 2023. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия, 2023;25. Приложение 1:64–65.Shamaeva S.H., Markova V.N., Egorova A.V., et al. Monitoring of carbapenem-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in a multidisciplinary hospital. Abstracts of the XXV International MACMACH Congress on Antimicrobial Therapy and Clinical Microbiology. Moscow, May 24-26, 2023. Clinical Microbiology and Antimicrobial chemotherapy. 2023; 25. Appendix 1:64–65.Белоцерковский Б.З., Круглов А.Н., Ни О.Г. и др. Этиологическая структура инфекций у пациентов отделения хирургической реанимации и интенсивной терапии в постковидную эпоху. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024;26(2):124–140. https://doi.org/10.36488/cmac.2024.2.124-140.Belotserkovskiy B.Z., Kruglov A.N., Ni O.G., Etiological structure of infections in patients of the surgical intensive care unit in the post-covid era. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2024; 26(2):124–140 (in Russian). https://doi.org/10.36488/cmac.2024.2.124-140/Быков А.О., Суворова М.П., Проценко Д.Н. и др. Анализ структуры бактериемий и чувствительности к антибиотикам микроорганизмов, выделенных в отделениях реанимации и интенсивной терапии в скоропомощном стационаре в период с 2003 по 2021 г.: ретроспективное наблюдательное исследование. Вестник интенсивной терапии имени А.И. Салтанова. 2023;(2):55–65. https://doi.org/10.21320/1818-474X-2023-2-55-65.Bykov A.O., Suvorova M.P., Protsenko D.N., et al. Analysis of the structure of bacteremia and antibiotic sensitivity of microorganisms isolated in intensive care units in a short-term hospital in the period from 2003 to 2021: a retrospective observational study. Bulletin of intensive care named after A.I. Saltanov. 2023;(2):55–65 (in Russian).Vogelaers D., Blot S., Van den Berge A., Montravers P. Abdominal Sepsis Study (‘AbSeS’) Group on behalf of the Trials Group of the European Society of Intensive Care Medicine. Antimicrobial Lessons From a Large Observational Cohort on Intra-abdominal Infections in Intensive Care Units. Drugs. 2021;81(9):1065– 1078. https://doi.org/10.1007/s40265-021-01534-w.Vogelaers D., Blot S., Van den Berge A., Montravers P. Abdominal Sepsis Study (‘AbSeS’) Group on behalf of the Trials Group of the European Society of Intensive Care Medicine. Antimicrobial Lessons From a Large Observational Cohort on Intra-abdominal Infections in Intensive Care Units. Drugs. 2021;81(9):1065– 1078. https://doi.org/10.1007/s40265-021-01534-w.Мещурова С.Ю., Коробова А.Г., Залепаев П.В. и др. Анализ спектра микроорганизмов, выделенных у больных с симптомами инфекции мочевыводящих путей в отделении реанимации и интенсивной терапии. Сборник тезисов Форума анестезиологов и реаниматологов России (ФАРР-2024). г. Санкт-Петербург, 12-14 октября 2024 г. СПб; 2024:172–173.Meschurova S.Yu., Korobova A.G., Zalipaev P.V., et al. Analysis of the spectrum of microorganisms isolated from patients with symptoms of urinary tract infection in the intensive care unit. Collection of abstracts of the Forum of Anesthesiologists and Intensive Care Specialists of Russia (FARR-2024). St. Petersburg, October 12-14, 2024. St. Petersburg; 2024:172–173. (in Russian).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.