vfumedВестник Северо-Восточного федерального университета имени М.К. Аммосова. Vestnik of North-Eastern Federal University. Серия «Медицинские науки. Medical Sciences»Vestnik of North-Eastern Federal University. Medical Sciences2587-5590Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосоваvfumed-292Research ArticleКЛИНИЧЕСКАЯ МЕДИЦИНАCLINICAL MEDICINEСУБГЕНОТИПИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ВИРУСА ГЕПАТИТА D В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ)SUBGENOTYPIC DIVERSITY OF HEPATITIS D VIRUS IN THE REPUBLIC OF SAKHA (YAKUTIA)СеменовС. И.SemenovS. I.

СЕМЕНОВ Сергей Иннокентьевич – доктор мед. наук, ведущий научный сотрудник Научно-исследовательского центра медицинского института 

г. Якутск, пр. М. Николаева, 13/1, корп. Д, кв. 162

Телефон: 8 (914) 286-29-48

SEMENOV Sergey Innokentievich – Dr. Sci (Medicine), leading researcher, Research Center, Institute of Medicine

Yakutsk, Mikhail Nikolaev Avenue, 13/1, building D, apartment 162

Рhone: +7 (914) 286-29-48

insemenov@yandex.ruПисареваМ. М.PisarevaM. M.

ПИСАРЕВА Мария Михайловна – канд. биол. наук, ведущий научный сотрудник 

г. Санкт-Петербург, ул. Ленина, дом 14, кв. 41

Телефон: 8(921) 752-09-26

PISAREVA Maria Mikhailovna – Cand. Sci (Biology), leading researcher

St. Petersburg, Lenin Street, Building 14, Apartment 41

Рhone: +7(921) 752-09-26

maria.pisareva@influenza.spb.ruФадеевА. В.FadeevA. V.

ФАДЕЕВ Артем Викторович – ст. науч. сотр. 

Новгородская область, г. Чудово, ул. Новгородская, до 1, кв. 21

Телефон: 8 (952) 249-68-21

FADEEV Artem Viktorovich – Senior Researcher

Novgorod Region, Chudovo, Novgorodskaya Street, building 1, apartment 21

Рhone: +7 (952) 249-68-21

afadeew@gmail.comКомиссаровА. Б.KomissarovA. B.

КОМИССАРОВ Андрей Борисович – зав. лабораторией молекулярной вирусологии 

г. Санкт-Петербург, ул. Парашютная, 12-715

Телефон: +7 (812) 499–15–00

KOMISSAROV Andrey Borisovich – head of the Laboratory of Molecular Virology

St. Petersburg, Parashyutnaya Street, 12-715

Рhone: +7 (812) 499–15–00

a.b.komissarov@gmail.comФГАОУ ВО «Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова»РоссияM. K. Ammosov North-Eastern Federal University”Russian FederationФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» МЗ РФРоссияA. A. Smorodintsev Research Institute of Influenza of the Ministry of Health of the Russian FederationRussian Federation202407102024034048Copyright © Семенов С.И., Писарева М.М., Фадеев А.В., Комиссаров А.Б., 20242024Семенов С.И., Писарева М.М., Фадеев А.В., Комиссаров А.Б.Semenov S.I., Pisareva M.M., Fadeev A.V., Komissarov A.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.smnsvfu.ru/jour/article/view/292

Вирусный гепатит D является одним из самых тяжелых форм среди вирусных гепатитов с риском развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы и трудно поддается лечению. Генотип 1 вируса D распространен повсеместно, другие генотипы распространены неоднородно по континентам. На территории России эндемичными по гепатиту D регионами являются Республики Тыва и Якутия. По нашим исследованиям, в Якутии встречаются генотип 1 и 2 вируса D. Цель исследований: определение репликативной активности вируса и их генотипического и субгенотипического разнообразия. Методы и материалы: секвенирование проводили методом Сэнгера на участке в 500 п.н. 3’-конца гена LHDAg. Методом ПЦР тестировано на вирусы гепатита D 499 человек. Результаты: заболеваемость вирусными гепатитами В снижается. В 2023 г. показатель острых вирусных гепатитов составил 0,40 на 100 тыс. населения (РФ – 0,34), хронических вирусных гепатитов В – 17,3 на 100 тыс. населения (РФ – 8,5). При определении вирусной нагрузки у 64 % больных была одновременная репликация обоих вирусов (HBV+HDV+), лишь у 36 % была репликация вируса D. Генотипирование вируса гепатита D выявило 1 генотип у 46,5 % больных, 2 генотип – у 53,5 %. Филогенетический анализ показал, что среди изолятов, относящихся к генотипу 1, 2 изолята 2019 года и 3 изолята из базы данных GenBank группируются с изолятами, относящимися к кластеру 1c и 3 изолята 2019 года и изолят Yakut-8 из базы данных GenBank сформировали отдельную ветвь, расположенную между кластерами 1с и 1е. Все изоляты генотипа 2 относились к субгенотипу 2b. Заключение: в Якутии распространен вирус гепатита Дельта 1 и 2 генотипов и впервые выявлены определены субгенотип 1с и субгенотип 2b.

Viral hepatitis D is one of the most severe forms of viral hepatitis with the risk of developing liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma and is difficult to treat. Genotype 1 of the D virus is widespread, with other genotypes distributed unevenly across continents. In Russia, the Republics of Tyva and Yakutia are endemic regions for hepatitis D. According to our research, genotypes 1 and 2 of the D virus are found in Yakutia. The aim of the study was to determine the replicative activity of the virus and their genotypic and subgenotypic diversity. Methods and materials: sequencing was performed using the Sanger method on a 500 bp section of the 3’-end of the LHDAg gene. 499 people were tested for hepatitis D viruses using the PCR method. Results: the incidence of viral hepatitis B is decreasing. In 2023, the rate of acute viral hepatitis was 0.40 per 100 thousand population (RF – 0.34), chronic viral hepatitis B – 17.3 per 100 thousand population (RF – 8.5). When determining the viral load, 64 % of patients had simultaneous replication of both viruses (HBV + HDV +), only 36 % had replication of the D virus. Genotyping of the hepatitis D virus revealed genotype 1 in 46.5 % of patients, genotype 2 – in 53.5 %. A phylogenetic analysis showed that among isolates belonging to genotype 1, 2 isolates of 2019 and 3 isolates from the GenBank database are grouped with isolates belonging to cluster 1c, and 3 isolates of 2019 and the Yakut-8 isolate from the GenBank database formed a separate branch located between clusters 1c and 1e. All isolates of genotype 2 belonged to subgenotype 2b. Conclusion: It is shown that hepatitis Delta virus of genotypes 1 and 2 are widespread in Yakutia, and subgenotype 1c and subgenotype 2b were identified for the first time.

вирусный гепатит Dхронический вирусный гепатит Dгепатит ВHDVanti-HDVHDV RNAвирусная нагрузкагенотипированиесеквенированиегенотипсубтипviral hepatitis Dchronic hepatitis Dhepatitis BHDVanti-HDVHDV RNAviral loadgenotypingsequencinggenotypesubtypeReferencesTuron-Lagot V., Saviano A., Schuster C., Baumert T.F., Verrier E.R. Targeting the Host for New Therapeutic Perspectives in Hepatitis D / J. Clin Med. 2020 Jan 14; 9 (1).Turon-Lagot V., Saviano A., Schuster C., Baumert T.F., Verrier E.R. Targeting the Host for New Therapeutic Perspectives in Hepatitis D. J. Clin Med. 2020 Jan 14; 9 (1).Vlachogiannakos J., Papatheodoridis G.V. New epidemiology of hepatitis delta /Liver Int. 2020 Feb; 40 Suppl 1: 48 – 53.Vlachogiannakos J., Papatheodoridis G.V. New epidemiology of hepatitis delta. Liver Int., 2020 Feb; 40 Suppl 1: 48–53.Гепатит дельта: этиология, клиника, диагностика, терапия (лекция для практических врачей) / Т.В. Кожанова, Л.Ю. Ильченко, М.И. Михайлов // Архивъ внутренней медицины – 2014. – № 5 (19). – С. 21 – 28.Gepatit del’ta: jetiologija, klinika, diagnostika, terapija (lekcija dlja prakticheskih vrachej). T.V. Kozhanova, L.Ju. Il’chenko, M.I. Mihajlov. Arhiv# vnutrennej mediciny, 2014, No. 5 (19), pp. 21–28.Абдурахманов Д.Т. Хронический гепатит В и D – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2010. – 288 с.: ил. (Серия «Библиотека врача-специалиста)Abdurahmanov D.T. Hronicheskij gepatit V i D. M.: GJeOTAR-Media, 2010. 288 s.: il. (Serija «Biblioteka vracha-specialista)Scarponi C.F., Kroon E.G., Vieira D.S., Fernandes A.P., Gomes K.B., Mota B.E. Molecular epidemiology of Hepatitis delta virus infection in Minas Gerais state from Brazil, an area outside the hyperendemic region of the Amazon Basin. Mem Inst Oswaldo/ Cruz. 2019; 114: e190074. doi: 10.1590/0074-02760190074Scarponi C.F., Kroon E.G., Vieira D.S., Fernandes A.P., Gomes K.B., Mota B.E. Molecular epidemiology of Hepatitis delta virus infection in Minas Gerais state from Brazil, an area outside the hyperendemic region of the Amazon Basin. Mem Inst Oswaldo/ Cruz. 2019; 114: e190074. doi: 10.1590/0074-02760190074Karimzadeh H., Usman Z., Frishman D., Roggendorf M. Genetic diversity of hepatitis D virus genotype-1 in Europe allows classification into subtypes /J.Viral Hepat. 2019 Jul; 26 (7): 900 – 910.Karimzadeh H., Usman Z., Frishman D., Roggendorf M. Genetic diversity of hepatitis D virus genotype-1 in Europe allows classification into subtypes. J.Viral Hepat. 2019 Jul; 26 (7): 900–910.Wranke A., Pinheiro Borzacov L.M., Parana R. et al., Clinical and virological heterogeneity of hepatitis delta in different regions world-wide: The Hepatitis Delta International Network (HDIN) /Liver Int. 2018 May; 38 (5): 842 – 850. doi: 10.1111/liv.13604. Epub 2017 Oct 26.Wranke A., Pinheiro Borzacov L.M., Parana R. et al., Clinical and virological heterogeneity of hepatitis delta in different regions world-wide: The Hepatitis Delta International Network (HDIN). Liver Int., 2018 May, 38 (5): 842–850. doi: 10.1111/liv.13604. Epub 2017 Oct 26.Ivaniushina V., Radjef N., Alexeeva M. et al. Hepatitis delta virus genotypes I and II cocirculate in an endemic area of Yakutia, Russia / Journal of General Virology. 2001. Т. 82. С. 2709/Ivaniushina V., Radjef N., Alexeeva M. et al. Hepatitis delta virus genotypes I and II cocirculate in an endemic area of Yakutia, Russia / Journal of General Virology, 2001, Vol. 82, p. 2709.Semjonov S.I., Savvin R.G., Nikitina S.G. et al. Parenteral viral hepatitis (B, C, D) in the Sakha Republic (Yakutia) / Life Science Journal. 2014. Т. 11. № 8s. С. 454 – 458.Semjonov S.I., Savvin R.G., Nikitina S.G. et al. Parenteral viral hepatitis (B, C, D) in the Sakha Republic (Yakutia). Life Science Journal, 2014, Vol. 11, No. 8s, pp. 454–458.Krivoshapkin V.G., Semenov S.I., Maximova S.S. et al. Clinical and laboratory characteristics of hepatitis D in Republic of Sakha (Yakutia) / Wiadomosci Lekarskie. 2018. Т. 71. № 1. С. 179 – 183.Krivoshapkin V.G., Semenov S.I., Maximova S.S. et al. Clinical and laboratory characteristics of hepatitis D in Republic of Sakha (Yakutia). Wiadomosci Lekarskie, 2018, Vol. 71, No. 1, pp. 179–183.Серологическая и молекулярно-биологическая верификация вирусных гепатитов В, С, D и Е у различных групп населения РС (Я) / С.И. Семенов, К.М. Степанов, Ф.А. Платонов [и др.] // Якутский медицинский журнал. – 2018 – № 4 (64) – С. 55 – 60.Serologicheskaja i molekuljarno-biologicheskaja verifikacija virusnyh gepatitov V, S, D i E u razlichnyh grupp naselenija RS(Ja). S.I. Semenov, K.M. Stepanov, F.A. Platonov [i dr.]. Jakutskij medicinskij zhurnal, 2018, No. 4 (64), pp. 55–60.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.